MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia cepacia AMMD plasmid 1

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008385	CGG	2	6	209	214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008385	TGGC	2	8	233	240	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008385	CGC	2	6	259	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008385	TTCCC	2	10	265	274	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_008385	GCGG	2	8	674	681	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008385	GAC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008385	AGG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008385	C	6	6	2379	2384	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_008385	GCC	2	6	2399	2404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008385	GGC	2	6	2414	2419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008385	T	7	7	2420	2426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008385	GCA	2	6	2486	2491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008385	CGA	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008385	CGGC	2	8	2646	2653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008385	GGC	2	6	2694	2699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008385	GCC	2	6	2704	2709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008385	CGC	2	6	2768	2773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008385	G	6	6	2910	2915	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008385	GGCC	2	8	2949	2956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008385	CGGC	2	8	2964	2971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008385	GGC	2	6	2996	3001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008385	GGCT	2	8	3017	3024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008385	GGC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008385	GC	3	6	3217	3222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008385	GTT	2	6	3279	3284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008385	A	6	6	3299	3304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008385	AAT	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008385	GCC	2	6	3342	3347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008385	G	6	6	3351	3356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008385	C	7	7	3359	3365	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_008385	C	6	6	3403	3408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_008385	AGGG	2	8	3631	3638	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008385	AAG	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008385	GGC	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008385	GGC	2	6	4881	4886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008385	CCGG	2	8	4894	4901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008385	GAA	2	6	6139	6144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008385	GGC	2	6	6808	6813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008385	TCA	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008385	ATC	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008385	TGC	2	6	6894	6899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008385	CAT	2	6	6938	6943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008385	GAT	2	6	6951	6956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008385	GCA	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008385	GCG	2	6	6982	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008385	GGA	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008385	TGC	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008385	GGC	3	9	7034	7042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008385	GAGCG	2	10	7055	7064	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008385	GGA	2	6	7107	7112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008385	CGG	2	6	8136	8141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008385	CAA	2	6	8160	8165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008385	ACC	2	6	10330	10335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008385	CCCA	2	8	10340	10347	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_008385	T	8	8	10370	10377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008385	A	7	7	10396	10402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008385	TGT	2	6	10433	10438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008385	ACA	2	6	10454	10459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008385	AGG	2	6	10473	10478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008385	GGTT	2	8	11523	11530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008385	T	6	6	11613	11618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008385	CCA	2	6	11642	11647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008385	AGG	2	6	12050	12055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008385	CGG	2	6	12727	12732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008385	T	6	6	12742	12747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008385	GAGG	2	8	12770	12777	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008385	CCG	2	6	12779	12784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008385	ATC	2	6	12798	12803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008385	GCA	2	6	12806	12811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008385	CGA	2	6	12822	12827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008385	GCC	2	6	12864	12869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008385	CTA	2	6	14522	14527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008385	GCG	2	6	14529	14534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008385	TGC	2	6	14627	14632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008385	TTA	2	6	14699	14704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008385	TG	3	6	14725	14730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008385	TATC	2	8	14755	14762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008385	CCG	2	6	14829	14834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008385	GA	3	6	14839	14844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008385	CGAGG	2	10	14845	14854	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008385	CTT	2	6	15231	15236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008385	GGC	2	6	15258	15263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008385	AC	3	6	19953	19958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008385	CG	3	6	26826	26831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008385	TCC	2	6	26836	26841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008385	TCC	2	6	26863	26868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008385	GCC	2	6	26888	26893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008385	T	8	8	26912	26919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008385	CTCG	2	8	26923	26930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008385	GGT	2	6	26989	26994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008385	TGG	2	6	27047	27052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008385	GCG	2	6	28981	28986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008385	CGG	2	6	29001	29006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008385	CGC	2	6	29007	29012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008385	GTC	2	6	29021	29026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008385	CTG	2	6	29054	29059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008385	TGA	2	6	29480	29485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008385	GACG	2	8	29498	29505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008385	GCA	2	6	29527	29532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008385	CTT	2	6	30040	30045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008385	GCCG	2	8	30104	30111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008385	CGA	2	6	30130	30135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008385	GCT	2	6	30142	30147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008385	GCA	2	6	30158	30163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008385	CCCTC	2	10	32268	32277	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.